Nella barriera corallina australiana vive Marlin, un pesce pagliaccio, con il figlioletto Nemo. Durante un litigio col padre, Nemo lascia la sicura barriera corallina per nuotare in mare aperto, e viene catturato da un umano. Marlin parte alla disperata ricerca del figlio, e al suo viaggio si unisce Dory, una svampita pesciolina blu con problemi di memoria. Nel frattempo il piccolo Nemo pianifica come fuggire dall’acquario in cui è stato rinchiuso. Tra squali vegetariani, tartarughe centenarie e meduse pungenti, riuscirà Marlin a ritrovare il suo pesciolino scomparso?